난분자생물학전공자_아무것도모르지 33

데자뷰란? 데자뷰의 과학적인 원인과 이유

데자뷰의 정체를 찾아서데자뷰는 "이미 본 것"을 의미하는 프랑스어 표현으로, 현재 경험하는 것이 이미 과거에 일어난 적이 있다는 느낌을 말합니다. 많은 사람들이 데자뷰를 경험하지만, 이 이상한 경험이 왜 발생하는지는 아직까지 알려져 있지 않습니다. 데자뷰는 1876년 프랑스의 철학자 에밀 보이락이 자신의 책 편집자에게 보낸 편지와 나중에 출간된 "미래의 심리학"이라는 책에서 처음 사용된 프랑스어 표현입니다. 데자뷰는 현재 경험 중인 것이 이미 과거에 발생한 것으로 느껴지는 경험입니다. 이 현상은 "기억의 착각"이라는 익숙함과 낯설음을 포함한 기억 현상으로 설명되며, "학습과 동기부여의 심리학" 책에 따르면 약 2/3의 사람들이 데자뷰를 경험하며, 나이가 들면서 데자뷰를 경험하는 빈도가 줄어든다고 합니다...

스피어만 상관분석 (Spearman's correlation) 방법

실험을 하다보면 세포에서 어떤 A유전자의 발현 정도와 B유전자의 발현 정도가 상관있는지 확인할 필요가 있습니다. 변수간의 관련성을 평가하는 방법입니다. 자세한 내용들은 인터넷을 찾으면 자세히 나옵니다. 왜 스피어만 상관분석을 알아야 할 까요? 스피어만 상관분석뿐만 아니라 통계적인 방법을 알고 있으면 하나의 실험을 하더라도 두개의 그림을 만들 수 있기 때문입니다. 공짜 데이터를 얻을 수 있다는 점에서 알아두면 유익하다고 할 수 있습니다. 데이터 하나 만들기가 얼마나 어렵습니까! 통계적인걸 알아두면 좀더 논문이 풍성해 보일 겁니다. 저는 간단하게 Spearman's correlation coffeicient (스피어만 상관계수)부터 말씀드리겠습니다. Rs값으로 표시되는 상관계수는 데이터간에 상관성을 나타내는..

유전자 분석을 위한 Primer design.

원하는 target gene의 발현을 확인하기 위해서는 유전자에 맞는 primer가 필요합니다. 숙달되신분들은 쉽게 만들겠지만 저는 초보자를 위한 방법을 적겠습니다. 순서대로 따라오시면 누구나 하실수 있습니다. 화이팅! 우선, 분석하려는 유전자의 variant들이 몇개씩 있습니다. 공통된 부분의 sequence를 찾아야지, 특정 variant의 sequence를 타겟하면 그것만 선택적으로 detection 하게 됩니다. 순서는 다음과 갔습니다. 1. target gene의 variant들의 공통적인 sequence를 찾아야합니다. 2. 공통적인 sequence를 이용하여 primer를 제작합니다. 1번이 조금 시간이 걸리지만 blast를 이용해서 쉽게 찾을 수 있고. 2번 같은 경우는 업체에서 제공하는 ..

인류의 운명은 어떻게 결정되었는가 - 총,균,쇠

총,균,쇠 [양장본] 국내도서 저자 : 제러드 다이아몬드(Jared M. Diamond) / 김진준역 출판 : 문학사상 2013.03.04 상세보기 의 저자 재러드 다이아몬드 박사는 이 책으로 퓰리처 상을 받았고, 학계나 일반 대중에게 문명을 바라보는 시선에 굉장히 영향력을 미치기도 했습니다. 현대 사회에 만연해 있는 불평등에 대해서, 국가 단위에서도 어떤 나라는 가난하고 어떤 나라는 부유하지, 오늘날 세계의 부가 불평등한 근본적인 원인은 무엇인지에 대해 다룬 굉장한 책이지요. 이 책의 성격이 워낙 다양합니다. 어떻게 보면 마르크스시즘처럼 결정론이기도하지만, 마르크시즘이 경제결정론이라면 는 지리결정론입니다. 가 탁월한 점은, 이 책에 실린 사례들이 풍부하고 매우 재미 있기때문이지만 무엇보다 1만 3000..

Immune cell surface 마커 종합

면역 세포를 분류하는 다양한 마커가 있습니다. 세포의 특징을 보여줄 수 있는 Antibody를 여러 개 붙이고, FACS를 이용하여 분석하지요. Antibody의 형광을 측정하고, Gating 하면서 분석된 세포가 어떤 세포인지 알아봅니다. FACS를 가끔 쓰는 사람으로써, 그리고 면역학 연구를 하지 않았기 때문에 다양한 세포들 사이에서 내가 원하는 세포의 구성과 변화를 볼 일이 많지 않았습니다. 하지만 Cytof라는 분석 기술을 알게 되었습니다. 보통 FACS는 최대 4-5개의 형광을 분석합니다. 그래서 Gating하는게 몇 개 되지 않습니다.(FACS 하시는 분들이 들으면 분노하실 것 같습니다만.. ) 형광을 이용한 분석법은 개수에 한계가 있습니다. 형광이 중첩되기 때문입니다. 하지만 cytof는 A..

박사 졸업후 취업 그리고 느낀 것들

박사학위를 딴 직후 박사과정생은 취업이라는 새로운 세계의 도전에 직면하게 됩니다. 많은 사람들의 기대감 앞에 서게 됩니다. 사실, 학위를 마치기 전까지 지도교수님이라는 큰 흐름에 자연스럽게 흘러갔다면, 졸업하니 강을 벗어나 뭍으로 올라온 느낌입니다. 황무지에 선 느낌이라고 할까요. 날 도와줄 사람 하나 없더군요. 날 도와줄 사람 하나 없더군요. 취업전선으로 뛰어들어보니 자괴감이 듭니다. 수년간 공부했던 것이 쓸모없게 느껴집니다. "잘 나가는 전공, 회사에서 선호하는 전공을 선택했었다면 얼마나 좋았을까" 후회가 몰려옵니다. 진작 알았으면 좋았을 텐데.. 미래를 준비하지 않은 자신이 싫어지기도 합니다. 기초학문을 연구한 저는 전공에 맞는 회사를 고른다는 것은 어려운 일이었습니다. 무엇보다 스스로 포기하게 됩..

여자 기숙사에서 생긴일 (월경 동기화 현상)

1971년 네이처 저널에 24살짜리 대학원생의 두쪽짜리 논문이 실리는 일이 있었습니다. 논문의 제목은 ‘월경 동기화와 억제 Menstrual Synchrony and Suppression’으로 여대 기숙사에서 발생하는 일에 대한 연구에 관한 것이었습니다. 여대 기숙사에서 함께 지내는 여학생들의 월경주기가 같아지고 (동기화), 한 주기의 주기가 길어진다는 (억제) 내용이었습니다. 이 연구가 주목 받은 이유는 아직까지 실체가 밝혀지지 않은 인간 페로몬 존재 가능성을 보여주었기 때문입니다. 페르몬은 곤충이나 동물들이 몸 밖으로 분비하는 생체분자로써, 같은 종에서 생리나 행동에 영향을 미친다. 1959년 네이처에 발표된 독일 막스플랑크연구소 페터 칼손 박사와 마틴 뤼셔 교수가 처음 이라는 용어를 사용하면서 알려..

기억을 삭제해드립니다. 기억을 없애는 방법

기억을 오래 유지하기 위해서는 시냅스간 연결이 형성되고 강화되어야 합니다. 생물학적으로 시냅스 연결이 많아지고, 장기기억이 형성되는 과정에서 단백질이 생성된다는 것은 이미 1960년대에 밝혀졌지요. 2000년 8월 기억에 새로운 페러다임을 변환시킨 연구결과가 발표되었습니다. 내용은 는 것입니다. 기억이 형성되는 과정에서 만들어지는 단백질에 의해 시냅스 부위가 형성되고 강화되는 과정을 거치게 됩니다. 만일 기억을 형성하는 과정에서 단백질 형성을 막는다면 경험이 기억으로 남지 않게 되죠. 하지만 이전에 일반적인 상식으로 형성된 기억을 강화하는 과정에서 단백질 형성을 막는 물질을 넣어도 이미 형성된 기억에 영향을 미치지 않을거라 생각했습니다. 강화과정은 존재하는 기억을 뇌에 다시 한번 각인 시키는 과정이라 생..

재조합 DNA 의약품 “제넨텍” 신화는 홀로 만들어지지 않았다.

휴물린(humulin)은 1982년 10월 FDA에 승인한 첫 재조합 DNA를 이용한 의약품입니다. 인간 인슐린을 DNA 재조합을 통해 박테리아에서 대량생산한 의약품으로써 그 과정은 연구자 혼자 이뤄낸 것이 아닙니다. 인간 인슐린 생산은 과학기술의 상용화를 위해 다양한 사람들의 노력과 아이디어의 결과임을 보여줍니다. EcoR1 제한효소 발견 UC샌프란시스코 허버트 보이어 교수의 연구주제는 제한효소였습니다. 1960년 대에 발견된 제한 효소는 박테리아가 외부에서 들어오는 바이러스를 막기 위한 효소로 바이러스 DNA를 절단하는 역할을 합니다. 제한효소의 특징은 특정 염기서열을 인식하여 자른다는 것입니다. 보이어 교수는 1972년 EcoR1이라는 제한효소를 발견하게 되는데 이것은 GAATTC 서열의 G와 A ..

[이직에 관한 생각] 나같은 충성스런 회사원 없지요!

회사에서 통보한 지 3개월 만에 충북지역으로 우리 팀은 이전하였습니다. 올해 연초에 일이었습니다. 대표님과 회의가 있는 날이었지만 출장으로 참석하지 못한 날이었습니다. 오후 집으로 가는길에 팀원에게 연락이 왔습니다. "대표님이 우리 XX로 가라는데요?! 3월에 이전하는 거로 하자고." 이건 무슨의미인가 생각하게 됐습니다. 가장 먼저 떠오르는 생각은 이번 이전을 통해 우리를 모두 내보내려는 의도인가? 였습니다. 일단 어떤 식으로 지원해줄지, 출퇴근비를 줄지 숙소를 줄지 결정된 것이 없었기 때문에 누가 과연 거기를 따라갈까 생각했습니다. 아마 다 그만두지 않을까 생각했습니다. 저도 마찬가지고요. 회사 사정에 따라 결정한 거겠지만 가족과 떨어져야 하는 상황을 만든 회사에 애정이 뚝뚝 떨어졌습니다. 잘 선택해야..