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폐암에 대한 공부를 하기 위해 내용을 찾고 ppt로 만들었습니다. 제가 폐암에 전문가는 아니지만 한번 개념을 이해하는데 조금 도움이 되지 않을까 싶습니다. 더불어 폐암 환자들에게 나오는 유전자 변이에 대해 초점을 맞춰서 준비해봤습니다. 일단 폐암이 발생하는 위치부터 알아야 할 것 같습니다. 폐암환자를 크게 나누면 흡연에 의해 발생하는 경우가 있는 반면에 유전적인 요인으로 인해 발생하는 경우로 나눌 수 있을 것 같습니다. 흡연환자들은 아무래도 Trachea, primary, secondary, Tertlary bronchus처럼 좀 더 기관지 가까운 곳에서 발생합니다. 하지만 유전적 요인으로 가지고 있는 분들은 alveoli 같이 폐 깊숙한 곳에서도 발생하는 것 같습니다. 폐암은 크게 2 종류로 나눌 수 ..

졸업한 지 언 일 년이 지났습니다. 실험실을 떠나온지 언 일 년이지만 실험실과의 연결 끈이 계속 있었으니.. 바로 입니다. 졸업전에 논문을 하나 투고하고 나왔습니다. 당연 졸업하고 나서 리비전이 왔지요. 작년 가을이었을까요?... 리뷰어 코멘트가 와서 출력을 했고, 이디야커피에서 천천히 읽었습니다. 리뷰어 중 한 명은 노벨상 수상자인가 봅니다. A4 양면으로 출력하고 보니 10장을 보내주었더라고요. 제 모든 피겨를 하나하나 지적하고 이렇게 저렇게 수정하라고 “아주 친절”하게 적어주었습니다. 사실 양면으로 10장을 적어 줄 정도면 Reject 줘도 되지 않았을까요? 놀랍겠도 ‘이런 내용을 수정하면 괜찮을 것 같아’라는 느낌였습니다...’실험마다 이런 샘플도 같이 해야지’라고 리뷰어가 쉽게 잘하지만, 이건 ..

아버지 텃밭에서 아이와 함께 배추, 당근, 무, 고구마등을 캤다. 평소 아버지가 키우신 야채들이 너무 맛있어서 은퇴후 귀농을 해야겠다고 생각까지 했는데. 오늘 드디어 아버지의 농사 비법을 알았다. 바로 GMO (Genetically modified Organisms) 오늘 그 증거를 찾았다. 바로 당근 DNA모양의 당근이 오늘 나오고 말았다. 아버지는 분명 유전자 조작을 하고 계신 것이다. ㅋ

미래학자들은 인간의 불멸을 예측하고 있고 있습니다. 불멸은 아니더라도 우리가 안경을 쓰듯이 기계로 된 장기는 하나씩 가지고 다닐거라고 예측하고 있습니다. 과학의 발전은 우리가 십년전 핸드폰과 지금의 핸드폰보다 더 빠른 속도로 달려가고 있습니다. 10년의 변화 충격을 3년, 혹은 그보다 더 빠른 시일에 느낄 것입니다. 사실, 이 부분에서 답답함을 느낍니다. 많은 사람들이 발전의 속도를 따라가지 못하고 있습니다. 저도 마찬가지로 다른 분야에서는 뒤쳐진 사람입니다. 어째든 유전체를 연구하는 사람으로써, 이 분야의 발전이 놀랍고 앞으로 암에서 큰 역할을 할거로 기대하고 있습니다. 하지만 이 좋은 걸 소수의 사람만 알고 있다는게 답답할 뿐입니다. 질병에 의한 사망원인중 단연 1위는 암일 것입니다. 지금의 의학으로..

췌장암 간략 소개 췌장은 길이 15cm의 가늘고 긴 모양을 가진 장기로 췌액이라 불리는 소화액을 분비해 십이지장으로 보내주는 역할을 함. 복강의 후복벽에 자리잡고 있는 췌장은 겉에서 만져지지도 않고, 개복해도 한눈에 들어오지 않아 진단이 어려움. 여러 장기들에 둘러싸여 몸 안쪽에 깊숙하게 위치해 있으며, 머리 부분은 십이지장과 연결돼 있고 췌장의 꼬리는 비장에 닿아 있음. 췌장은 머리, 몸통, 꼬리의 3부분으로 나뉘어져 있으며 섭취한 음식물 중의 탄수화물, 지방, 단백질을 분해시키는 소화 효소를 분비하는 외분비 기능과 혈당을 조절하는 인슐린과 글루카곤 등의 호르몬을 분비하는 내분비 기능을 가지고 있음. 췌장은 두께가 2cm정도로 얇으며 피막만으로 쌓여 있는 데다가 소장에 산소를 공급하는 상장간막 동맥과 ..

SENSITIVITY and SPECIFICITY Sensitivity (민감도) #질병있는 사람을 얼마나 잘 찾는지. 환자를 환자로 평가 Sensitivity : True Positive Rate (TPR) = a / (a + b) Specificity (특이도) #정상을 얼마나 잘 찾는지 평가. 정상을 정상으로 평가 Specificity : True Negative Rate(TNR) = d / (c + d) Precision (정밀도) #Positive로 예측한 샘플들 중 실제로 Positive인 비율_질병이 있다고 예측한 사람등 중 실제로 아픈 사람이 어느 정도인지 평가 Precision: a / (a + c) Accuracy (정확도) Accuracy: (a+d)/(a+b+c+d) 임상에서 민감도..

RECIST (response evaluation criteria in solid tumors) Baseline에서 종양 병변은 다음과 같이 2가지로 분류한다. 1) 계측 가능한 병변 (measurable) 최소한 한 방향으로 정확히 계측할 수 있는 병변을 말한다. 일반적인 계측방법 (physical examination 또는 X-ray, CT scan, MRI)으로 가장 긴 직경의 길이가 20mm 이상이거나 spiral CT scan으로 가장 긴 직경의 길이가 10mm 이상인 병변을 말한다. 2) 계측 불가능한 병변 (nonmeasurable) 계측 가능한 병변 외의 다른 모든 병변을 말한다. 작은 병변(일반적인 계측방법으로 가장 긴 직경의 길이가 20 mm 이하거나 spiral CT scan(5 mm..

TNM staging system ▪ Cancer의 type을 나타내는데 사용한다. -암이 발생한 인체부위. -cell type (such as, adenocarcinoma, squamous cell carcinoma) -tumor size -lymph node에 가까이 퍼져 있는지. -인체 다른 곳으로 퍼져 있는지. -Tumor grade, 얼마나 암세포가 비정상으로 보이는지, 얼마나 성장하고 퍼졌는지. 등의 내용을 포함한다. ▪ brain, spinal cord, blood cancer에서는 다른 표기 법을 사용하지만 TNM staging system은 가장 널리 사용되는 시스템이다. T: 주 종양(main tumor)의 크기를 말한다. 주 종양은 보통 primary tumor라고 한다. N: lym..

에서 primer를 제작하는 방법을 말씀드렸습니다. (클릭 클릭) 몇몇 분이 디자인한 primer가 타깃 유전자만 specific 하게 결합하는지 알고 싶어 하셨습니다. 저도 이후 과정을 적어야겠다고 생각했는데 시간이 없어서 적지 못했습니다. 사실, 복잡한 과정이 아니라서 간단하게 적어보겠습니다. 먼저 NCBI에 들어가셔서 맨 아래 를 클릭해서 들어갑니다. 다른 내용은 잘 모르겠고, 빨간 박스만 채워줍니다. 빨간 박스에 위에 에서 제작한 sequence를 붙여 넣습니다. forward / reverse sequence를 잘 넣어줍니다. 저는 SMAD2를 detection 하는 primer를 제작하였습니다. 아래 보시면 를 클릭해줍니다. *제가 t를 하나 빼먹어서 다시 적었습니다. 아래 결과는 제대로 된 ..

특집, 당신의 정자는 안녕하십니까? 부제: 아빠의 정자 DNA가 아이의 건강과 두뇌, 미래를 결정한다. 지구상에 살아가는 생물 가운데 부성애가 가장 강하다는 가시고기. 가시고기는 1급수의 맑은 물에서만 발견되는 희귀한 물고기인데요,크기가 워낙 작고 빛깔조차 돌이나 바위와 비슷하여 유심히 살펴보지 않으면 눈에 잘 띄지 않을 만큼 작디작은 생명체. 그런데 이 아빠 가시고기의 일생을 아십니까. 아빠 가시고기는 새끼를 낳을 때가 되면 몸이 평소보다 선명한 분홍빛으로 변합니다.온몸에서 끈적끈적한 액체를 분비하여 엄마 가시고기가 알을 잘 낳을 수 있도록 정성껏 둥지를 만듭니다. 아빠 가시고기의 슬픈 숙명은 지금부터 시작이지요. 원인이 밝혀지지 않았지만, 엄마 가시고기는 알을 낳자마자 둥지를 떠납니다. 그러면 아빠 ..