Oddientist DK

오랫동안 미뤄왔던 굿노트에 대한 리뷰를 작성하려고 합니다. GoodNotes 4였는데, 어느덧 GoodNotes 5를 사용하고 있습니다. 4였을때 리뷰를 했다면 칭찬으로 리뷰가 마무리되었을 텐데, 5는 오류가 아직도 많아서 좋은 소리로 끝날 것 같지 않습니다. 그래도 만든 사람도 버그 잡기 위한 노력을 엄청하고 있다는게 느껴집니다. 시도 때도 없이 업데이트가 이뤄지고 있기 때문입니다. 어쨌든 아직도 완전하지 않지만 그래도 잘 쓰고 있기 때문에 리뷰를 해보겠습니다. 주용도: 논문 읽기 굿노트를 필기용으로 사용하시는 분도 많을 겁니다. 필기도 하지만 저의 주용도는 PDF 논문 파일을 불러와 필기하면서 보기 위함입니다. 구입목록에 liquidtext도 있습니다. 리퀴드 텍스트 같은 경우는 여러 편의 PDF 파..

미래학자들은 인간의 불멸을 예측하고 있고 있습니다. 불멸은 아니더라도 우리가 안경을 쓰듯이 기계로 된 장기는 하나씩 가지고 다닐거라고 예측하고 있습니다. 과학의 발전은 우리가 십년전 핸드폰과 지금의 핸드폰보다 더 빠른 속도로 달려가고 있습니다. 10년의 변화 충격을 3년, 혹은 그보다 더 빠른 시일에 느낄 것입니다. 사실, 이 부분에서 답답함을 느낍니다. 많은 사람들이 발전의 속도를 따라가지 못하고 있습니다. 저도 마찬가지로 다른 분야에서는 뒤쳐진 사람입니다. 어째든 유전체를 연구하는 사람으로써, 이 분야의 발전이 놀랍고 앞으로 암에서 큰 역할을 할거로 기대하고 있습니다. 하지만 이 좋은 걸 소수의 사람만 알고 있다는게 답답할 뿐입니다. 질병에 의한 사망원인중 단연 1위는 암일 것입니다. 지금의 의학으로..

췌장암 간략 소개 췌장은 길이 15cm의 가늘고 긴 모양을 가진 장기로 췌액이라 불리는 소화액을 분비해 십이지장으로 보내주는 역할을 함. 복강의 후복벽에 자리잡고 있는 췌장은 겉에서 만져지지도 않고, 개복해도 한눈에 들어오지 않아 진단이 어려움. 여러 장기들에 둘러싸여 몸 안쪽에 깊숙하게 위치해 있으며, 머리 부분은 십이지장과 연결돼 있고 췌장의 꼬리는 비장에 닿아 있음. 췌장은 머리, 몸통, 꼬리의 3부분으로 나뉘어져 있으며 섭취한 음식물 중의 탄수화물, 지방, 단백질을 분해시키는 소화 효소를 분비하는 외분비 기능과 혈당을 조절하는 인슐린과 글루카곤 등의 호르몬을 분비하는 내분비 기능을 가지고 있음. 췌장은 두께가 2cm정도로 얇으며 피막만으로 쌓여 있는 데다가 소장에 산소를 공급하는 상장간막 동맥과 ..

SENSITIVITY and SPECIFICITY Sensitivity (민감도) #질병있는 사람을 얼마나 잘 찾는지. 환자를 환자로 평가 Sensitivity : True Positive Rate (TPR) = a / (a + b) Specificity (특이도) #정상을 얼마나 잘 찾는지 평가. 정상을 정상으로 평가 Specificity : True Negative Rate(TNR) = d / (c + d) Precision (정밀도) #Positive로 예측한 샘플들 중 실제로 Positive인 비율_질병이 있다고 예측한 사람등 중 실제로 아픈 사람이 어느 정도인지 평가 Precision: a / (a + c) Accuracy (정확도) Accuracy: (a+d)/(a+b+c+d) 임상에서 민감도..

​ 왠지 몸에 해로울 것 같아....

RECIST (response evaluation criteria in solid tumors) Baseline에서 종양 병변은 다음과 같이 2가지로 분류한다. 1) 계측 가능한 병변 (measurable) 최소한 한 방향으로 정확히 계측할 수 있는 병변을 말한다. 일반적인 계측방법 (physical examination 또는 X-ray, CT scan, MRI)으로 가장 긴 직경의 길이가 20mm 이상이거나 spiral CT scan으로 가장 긴 직경의 길이가 10mm 이상인 병변을 말한다. 2) 계측 불가능한 병변 (nonmeasurable) 계측 가능한 병변 외의 다른 모든 병변을 말한다. 작은 병변(일반적인 계측방법으로 가장 긴 직경의 길이가 20 mm 이하거나 spiral CT scan(5 mm..

TNM staging system ▪ Cancer의 type을 나타내는데 사용한다. -암이 발생한 인체부위. -cell type (such as, adenocarcinoma, squamous cell carcinoma) -tumor size -lymph node에 가까이 퍼져 있는지. -인체 다른 곳으로 퍼져 있는지. -Tumor grade, 얼마나 암세포가 비정상으로 보이는지, 얼마나 성장하고 퍼졌는지. 등의 내용을 포함한다. ▪ brain, spinal cord, blood cancer에서는 다른 표기 법을 사용하지만 TNM staging system은 가장 널리 사용되는 시스템이다. T: 주 종양(main tumor)의 크기를 말한다. 주 종양은 보통 primary tumor라고 한다. N: lym..

집이 이사를 하고, 새로운 집을 꾸미기 위해서 다양한 택배들이 배달되고 있습니다. 아기 기저기, 옷, 장난감도 속속 배달되고 있죠. 저는 택배 상자의 테이프와 송장을 떼고 고이 접어서 버리는 역할을 합니다. 빈 택배 상자를 보니 약간은 서러움이 몰려 왔습니다. 제 택배는 없거든요. 책도 주로 도서관에서 빌리거나, 학교 도서관을 이용하여 전자도서로 봅니다. 제가 보고 싶은 것을 찾아 보기보다 있는 것 중에 골랐습니다. 그래서 날 위해!! 큰 맘 먹고 책을 사기로 했습니다. 정말 살까 말까 살까 말까 계속 고민하다가 질렀습니다. 가장의 무게란...ㅜㅜ 어떤 책을 고를까해서 기왕이면 여름에 재미있는 소설이 보고 싶었습니다. 읽고 반해버린 찬호께이 소설을 다 보고 싶어서 두 권의 책을 샀습니다. 바로, , 정말..

박사과정에 내가 얻은 것은 무엇인가’ ‘나의 진로는 어떻게 될 것인가’ ‘과연 잘할 수 있을까’ 지난 4년간 동안 생각해본 적 없던 이야기를 어제 하루에 깊이 생각해봤습니다. 뜬금없이 왜 이런 생각을 했을 까요? 바로, 어제가 ‘학위논문심사 날’이었기 때문입니다. 요즘 한참 심사기간이라서 많은 사람들이 저와 비슷한 생각을 하고 있을 것 같습니다. 밤잠을 설치고 있겠죠. 논문심사 시간은 지난 시간 동안 연구한 내용을 발표할 뿐 아니라 지난 내 삶과 노력도 발표하는 시간이었습니다. 통과는 했으나, 교수님들의 날카로운 칼날에 4년간의 노력은 이리저리 찢겨 너덜너덜해졌습니다. 마치 결과가 없었던 것처럼. 모든 학위를 위한 노력에 고하가 어디 있나. 싶지만 결과를 받아들이는 교수님의 입장은 다른 가봅니다.. 사람..

에서 primer를 제작하는 방법을 말씀드렸습니다. (클릭 클릭) 몇몇 분이 디자인한 primer가 타깃 유전자만 specific 하게 결합하는지 알고 싶어 하셨습니다. 저도 이후 과정을 적어야겠다고 생각했는데 시간이 없어서 적지 못했습니다. 사실, 복잡한 과정이 아니라서 간단하게 적어보겠습니다. 먼저 NCBI에 들어가셔서 맨 아래 를 클릭해서 들어갑니다. 다른 내용은 잘 모르겠고, 빨간 박스만 채워줍니다. 빨간 박스에 위에 에서 제작한 sequence를 붙여 넣습니다. forward / reverse sequence를 잘 넣어줍니다. 저는 SMAD2를 detection 하는 primer를 제작하였습니다. 아래 보시면 를 클릭해줍니다. *제가 t를 하나 빼먹어서 다시 적었습니다. 아래 결과는 제대로 된 ..